Из-за того, что Агентство не смогло в установленный срок завершить обработку данных сельскохозяйственной переписи, сборники "Сельское, лесное, рыбное хозяйство", "Регионы Казахстана", "Казахстан в цифрах", содержащие важнейшие показатели развития агропромышленного комплекса, не были изданы в 2007 году. Между тем на эти цели было предусмотрено Т5,4 млн.
Счетным комитетом выявлены нарушения в сфере обработки статистических данных. Так, не решен вопрос действующих и недействующих предприятий (временно бездействующих, либо банкротов или тех, которые прекратили свое существование). Наблюдаются существенные недостатки и по подготовке статистической информации о малом бизнесе, частных предпринимателях.
В ходе контроля были установлены финансовые нарушения. В частности, не обеспечено эффективное использование освобожденного Агентством служебного помещения в Алматы, переданного с 1 июня 2007 года Министерству внутренних дел для размещения Центральноазиатского регионального информационно-координационного центра по борьбе с незаконным оборотом наркотических средств и их прекурсоров. При этом затраты Агентства на содержание служебных помещений составили Т1,6 млн. А при приобретении квартир для госслужащих, передислоцированных из Алматы в Астану, Агентством не соблюдены и завышены более чем в два раза нормативы площадей, предусмотренные статьей 75 Закона "О жилищных отношениях". Несмотря на то, что готовность закупаемых агентством 93 квартир составляла 60-70%, была произведена стопроцентная предоплата, что противоречит Правилам исполнения республиканского и местных бюджетов. В результате по состоянию на 1 января 2008 года образовалась дебиторская задолженность в сумме Т1,2 млрд.
Кроме того, из-за неправильного исчисления средней заработной платы семи сотрудникам агентства и членам их семей переплачена компенсация на сумму Т1,2 млн, а также двум работникам, не вошедшим в список передислоцируемых, необоснованно выплачена компенсация в размере Т1,4 млн.
Счетный комитет рекомендовал Агентству по статистике разработать меры по повышению эффективности использования бюджетных средств, выделяемых на совершенствование государственной статистики, улучшение качества обработки показателей статистической отчетности и тиражирование статистических данных.