Сейчас на всех трех имеющихся в Казахстане НПЗ готовятся к реализации проекты модернизации, которые в будущем позволят увеличить совокупный объем выпуска ГСМ (в частности, нарастив объем светлых нефтепродуктов), одновременно улучшив их качество. Программы модернизации и реконструкции на каждом из них оцениваются приблизительно в $1 млрд и выше.

По информации Министерства нефти и газа, на Атырауском НПЗ к настоящему времени уже завершена разработка проектно-сметной документации проекта “Строительство комплекса глубокой переработки нефти”. Приказом “КазМунайГаза” создана рабочая группа, которой будут вестись работы по вопросам его реализации. Общим собранием участников АНПЗ в качестве подрядчика выбран консорциум Marubeni/SinopecEngineering/КСС. Между PKOP и HILL подписан Меморандум о сотрудничестве по проекту строительства на Шымкентском НПЗ завода по производству базовых масел. На ТЭО проекта модернизации, выполненного Technip, получено положительно заключение РГП “Гос экспертиза”, Министерства охраны окружающей среды и Министерства по чрезвычайным ситуациям. Кроме того, 31 октября 2011 года было получено положительное заключение “Госэкспертизы” №01-420/11 на ТЭО проекта реконструкции и модернизации ПНХЗ.

По данным АО “Информационно-аналитический центр нефти и газа” Миннефтегаза, по итогам 2011 года переработка нефти на отечественных НПЗ составила        13 725,7 тыс. тонн. Из переработанной нефти на трех НПЗ произведено: бензина -      2757,6 тыс. тонн (95,3%); дизельного топлива - 4064,3 тыс. тонн (99,8%); мазута -       3660,1 тыс. тонн (97,1%); авиакеросина - 387,1 тыс. тонн (79,1%). Снижение производства нефтепродуктов связано с тем, что в 2011 году западносибирская нефть, поставляемая на ПНХЗ, имеет тенденцию к утяжелению и увеличению содержания серы. Особенно ухудшение качества нефти наблюдалось в первом полугодии, когда содержание серы увеличилось до 1,22% (технологическое оборудование рассчитано на переработку нефти с содержанием серы менее 1%). Это ведет к уменьшению глубины переработки и выработки светлых нефтепродуктов на 10%, к увеличению выхода котельного топлива, а также к преждевременному износу оборудования.