Первый бензин на ШНПЗ был получен в начале 1985 года в результате13 лет строительства и транспортно-технологической увязки объектов добычи нефти в Западной Сибири с мощностями по переработке в Южном Казахстане. Сегодня основным сырьем для завода служит нефть с месторождения Кумколь в Кызылординской области, а линейка продуктов ШНПЗ включает бензины всех марок, дизельное топливо и авиакеросин. Несмотря на максимальную загрузку производственных мощностей, в 2010 году спрос на продукцию ШНПЗ начал превышать предложение, в результате была запланирована поэтапная модернизация завода, в том числе в рамках ГПФИИР.
Проект модернизации ПКОП реализуется в 2 этапа. На первом планируется освоить выпуск моторного топлива экологических классов К4 и К5 (аналоги Евро-4 и Евро-5), согласно требованиям Технического регламента Таможенного Союза. Для этой цели на предприятии реконструируются существующие и строятся новые технологические установки: установка изомеризации, установка по производству серы мощностью 4000 тонн в год, реконструкция установки гидроочистки дизельного топлива. После их ввода в эксплуатацию вся продукция завода получит маркировку на соответствие стандартам Евро-4 и Евро-5.
Второй этап модернизации отведен для доведения объемов выпуска продукции завода до 6 млн тонн в год и увеличения глубины переработки нефти до 80%. На этом этапе арсенал предприятия пополнится установками каталитического крекинга “RFCC”, гидроочистки бензина “Prime G+”, производства серы, очистки водорода и другими. По завершении второго этапа производство высокооктановых бензинов на заводе возрастет с 735 до 2 186 тыс. тонн в год, дизельного топлива - с 1346 до 1946 тыс. тонн в год, авиатоплива - с 280 до 425 тыс. тонн в год. Доля высокооктановых автобензинов составит 100% в пуле выпускаемой продукции.
Завершение проектов намечено на IV квартал 2017 года.